作為一項復雜的系統工程，集裝箱運輸是一個多環節、多活動、多部門的組合，實現不同形式的集裝箱運輸需要不同的利益相關者的參與，一般情況下，利益相關者包括：無船承運人、集裝箱實際承運人、集裝箱租賃公司、集裝箱堆場、集裝箱貨運站等。

無船承運人

專門從事攬貨、拆箱、內陸運輸的無船承運人，以及經營中轉站或內陸站等集裝箱貨物運輸的，可以配備各自的實際運輸工具，也可以不配備。對于實際承運人而言，他是承運人，對于實際承運人而言，他又是托運人，無船承運人一般應遵守所在國的法律，并向相關政府部門登記。

實際承運人
 

實運者掌握運輸工具，參與集裝箱運輸活動，集裝箱數量大，便于集裝箱的周轉、調撥、管理，便于與車船機連接。

集裝箱租賃公司

集裝箱出租公司是一家專門從事集裝箱出租業務的新型企業。

集裝箱堆場

貨柜堆場是辦理集裝箱重箱或空箱裝卸，轉運，保管，交接的場所。

集裝箱貨運站

集裝站是處理拼箱貨的地方，它負責拼箱貨的交接、配載、裝好后，把箱子送到集裝箱堆場，并接受交來的“集裝箱”，進行分箱、理貨、保管，最后交給收貨人。此外，還可按承運百分比的比例委托主席或副主席簽發場站收據等業務。
 

由整個集裝箱運輸體系看，又分為基本關系方、代理方、中立方。基礎相關方包括托運人、收貨人、內陸運輸承運人、海運承運人、港口、貨運站等，依據這些基礎關系就能完成集裝箱運輸的基礎環節。因為集裝箱貨物運輸的專業化，集裝箱運輸業務處理是一個十分復雜、煩瑣的工作，所以集裝箱運輸。如果大家有海運運輸需要，可以選擇寧波海運這樣專業的公司。

基礎關系方往往會委托特定的專業人員進行相關業務，因此出現了集裝箱運輸代理方，代理人因其代理業務的著重點不同，又可分為船代理和貨代代理。中立方本身并不從事特定的集裝箱運輸業務，而僅僅作為政府職能部門，為海關、檢驗檢疫等各集裝箱運輸關系方提供公共服務。